Předmluva 9 // Úvodem 18 // • Postavení baktérií v soustavě živých organismů 18 // • Vznik a vývoj baktérií 24 // • Význam životní činnosti baktérií v hospodářství přírody a člověka 28 // Doporučená literatura 32 // Bakteriální buňka 33 // Bakteriální buňka jako forma existence živé hmoty 33 // • Bakteriální buňka jako systém 33 // • Modely a modelování bakteriální buňky 34 // • Regulace 42 // • Informace 45 // • Organizace 50 // • Identifikující vlastnosti živých systémů 51 // • Biologické generalizace 54 // • Úloha slabých chemických vazeb v životních dějích 56 // Stavba bakteriální buňky 60 // • Vnitřní uspořádání, tvar a velikost bakteriální buňky 60 // • Prvkové složení bakteriální buňky 65 // • Molekulární složení bakteriální buňky 67 // • Voda 70 // • Bílkoviny 71 // • Nukleové kyseliny 77 // • Polysacharidy 82 // • Lipidy 83 // • Supramolekulární útvary v bakteriální buňce 89 // Funkční části bakteriální buňky 92 // • Jádro 92 // • Plazmidy 93 // • Cytoplazma 95 // 5 • Ribozómy 95 // • Rezervní materiál 98 // • Cytoplazmatická membrána 99 // • Stěna bakteriální buňky 106 // • Peptidoglykan 108 // • Buněčná stěna grampozitivních baktérií 115 // • Buněčná stěna gramnegativních baktérií 118 // • Pouzdro 124 // • Fimbrie 125 // • Bičíky 125 // • Glykokalyx 130 // Úlohy 133 // Doporučená literatura 136 // Růst a množení baktérií 138 // Růst a množení individuální bakteriální buňky 138 // • Jak rostou baktérie ? 138 // • Růst individuální bakteriální buňky 143 // • Jaderné dělení 148 // • Buněčné dělení 153 // • Životní cyklus baktérie 155 // • Synchronizace dělení 162 // • Sporulace a spory 167 // • Diferenciace u baktérií 181 //
Růst a množení bakteriální populace v tekutém homogenním prostředí 183 // • Růstová křivka 183 // • Baktérie se množí geometrickou řadou 187 // • Mezi vytvořenou biomasou baktérií a spotřebovanou živinou je lineární vztah // přímé úměrnosti 193 // • Specifická růstová rychlost ц je funkcí koncentrace živiny i 195 // • Základní matematický model růstové křivky baktérií 198 // • První varianta základního matematického modelu: logistická křivka 201 // • Druhá varianta základního matematického modelu: zahrnuje udržovací meta- // bolismus 204 // • Třetí varianta základního matematického modelu: zahrnuje brzdicí efekt // zplodin metabolismu 207 // • Další varianty základního matematického modelu růstové křivky 210 // • Model růstu a množení smíšené kultury baktérií 215 // • Model růstu a množení bakteriální kultury se vznikem mutantů 218 // • Lag-fáze 221 // • Exponenciální fáze 226 // • Co určuje rychlost exponenciálního růstu? 240 // 9 Stacionární fáze 254 // • Růstový výtěžek 260 // • Energetika růstu baktérií 263 // • Termodynamika a růst baktérií 270 // 9 Různé způsoby vyjadřování růstového výtěžku 279 // • Fáze odumírání 282 // • Diauxie 286 // • Lineární růst 289 // Růst a množení bakteriální populace v kontinuální kultuře 291 // • Kontinuální kultivace baktérií 291 // • Kontinuální kultivace v otevřeném homogenním jednostupňovém // systému 294 // • Turbidostat 295 // • Chemostat 296 // • Stanovení udržovací energie v chemostatu 307 // • Fyziologie chemostaticky rostoucích baktérií 308 // • Ekologie v chemostatu 311 // • Mutace v chemostatu 315 // • Dvoustupňový chemostat 316 // Úlohy 318 // Doporučená literatura 320 //
Metabolismus baktérií 323 // Metabolismus jako celek 323 // • Základní procesy metabolismu 323 // • Katabolismus a anabolismus 325 // • Spřažení katabolismu s anabolismem 327 // • Volná energie 332 // • Biologické oxidoredukce 337 // • Fosfát jako přenašeč energie 342 // • Centrální role ATP v přenosu energie 345 // • Centrální role NAD(P)+ v metabolismu 353 // • Metabolismus jako tok energie, hmoty a informace živým systémem 356 // • Enzymy 367 // Energetický metabolismus chemoorganotrofních baktérií 375 // • Globální schéma katabolismu chemoorganotrofů 375 // • Fermentace obecně 378 // • Fermentace u baktérií 383 // • Aerobní respirace 393 // • Elektrontransportní systém baktérií 401 // • Oxidační fosforylace a transformace energie v bakteriální membráně 414 // • Dýchání baktérií 428 // • Respirace nitrátu 434 // • Respirace fumarátu 439 // • Respirace tetrationátu 443 // • Respirace síranů 446 // • Respirace CO2 451 // • Pentózový cyklus (fosfoglukonátová dráha) 453 // • Vstup polysacharidů a cukrů do katabolismu 455 // • Vstup lipidů do katabolismu 461 // • Vstup bílkovin a aminokyselin do katabolismu 462 // • Vstup ostatních organických látek do katabolismu 464 // Energetický metabolismus chemolitotrofních baktérií 469 // • Globální schéma katabolismu chemolitotrofů 469 // • Autotrofní fixace CO2 (Calvinův cyklus) 471 // • Nitrifikační baktérie 475 // • Sirné baktérie 479 // • Železité baktérie 481 // • Vodíkové baktérie 482 // Energetický metabolismus fototrofních baktérií 485 // • Fotosyntéza u baktérií 485 // • Bakteriorodopsinová fotosyntéza 493 // Biosyntéza malých molekul 495 // • Celková metabolická mapa bakteriální buňky 495 // • Syntéza cukrů 497 // • Syntéza mastných kyselin 498 //
• Syntéza nukleotidů 500 // • Syntéza aminokyselin 504 // • Fixace vzdušného dusíku 507 // • Heterotrofní fixace CO2 510 // • Sekundární metabolismus 512 // Syntéza makromolekul 514 // • Syntéza polysacharidů 514 // • Syntéza lipidů 516 // • Syntéza DNA (replikace a reparace) 517 // • Syntéza RNA (transkripce) 524 // • Syntéza bílkovin (translace) 530 // Úlohy 538 // Doporučená literatura 540 // Regulace metabolismu 544 // Základní regulační mechanismy buňky 544 // • Metabolismus je regulován 544 // • Změna rychlosti enzymové reakce změnou koncentrace substrátu // a produktu 545 // • Změna rychlosti enzymové reakce změnou koncentrace aktivní formy // enzymu 550 // • Regulace aktivity enzymu alostérickou interakcí s metabolitem (zpětná // vazba) 551 // • Regulace aktivity enzymu kovalentní chemickou modifikací 557 // • Regulace rychlosti syntézy enzymu 560 // • Regulace rychlosti degradace enzymu 565 // Regulace některých dílčích metabolických systémů 566 // • Regulace glykolýzy a Krebsova cyklu (Pasteurův efekt) 566 // • Regulace metabolismu energetickým nábojem a redukčním nábojem 568 // • Kyslíkový efekt 570 // • Efekt Crabtree 575 // • Glukózový efekt 576 // • Katabolická represe a cyklický AMP 580 // • Regulační role guanozintetrafosfátu (ppGpp) 585 // • Postupná indukce 587 // • Regulace v biosyntetických dráhách 588 // • Regulace aktivity a syntézy glutaminsyntetázy u Escherichia coli 590 // • Enzymy jako represory 592 // • Regulace Am-systému 593 // Doporučená literatura 595 // Řešení úloh 597 // Věcný rejstřík 600