Obsah // Předmluva autora...9 // Slovo recenzenta...Ю // Slovo nakladatele...1<) // 1. ÚVOD DO LÉKAŘSKÉ MIKROBIOLOGIE...11 // 1.1 Předmčt lékařské mikrobiologie...13 // 1.2 Přehled mikrobiálních agens...13 // 1.3 Historie nauky o infekcích...13 // 1.4 Význačné postavy naší mikrobiologie...14 // 1.5 Nositelé Nobelovy ceny v mikrobiologii a v příbuzných oborech...16 // 2. ZÁKLADNÍ VLASTNOSTI BAKTERIÍ...1’-» // 2.1 Taxonomie bakterií...21 // 2.2 Velikost, tvar a uspořádání bakterií...22 // 2.3 Barvitclnosl dle Grama...24 // 2.4 Stavba bakteriální buňky...25 // 2.4.1 Cytoplasmalická membrána...25 // 2.4.2 Buněčná stěna...26 // 2.4.3 Extracclulární polymery...27 // 2.4.4 Bakteriální bičíky...27 // 2.4.5 Pili (fimbric)...28 // 2.4.6 Cytoplasma a struktury v ni uložené...28 // 2.4.7 Bakteriální spory...29 // 2-5 Metabolismus bakterií...30 // 2.5.1 Funkce enzymů...30 // 2.5.2 Inhibitory enzymů...30 // 2.5.3 Využití bakteriálních enzymů...31 // 2.5.4 Zdroje energie a uhlíku pro mikrobiální buňku...31 // 2.5.5 Metabolické procesy, při nichž se uvolňuje energie...31 // 2.5.5.1 Fermcntace...31 // 2.5.5.2 Respiracc...32 // 2.5.5.3 Mikroorganismy neschopné získávat samy energii...32 // 2.5.5.4 Rozdělení mikrobů podle vztahu ke kyslíku...32 // 2.5.6 Biosyntéza...33 // 2.5.7 Význam metabolismu mikrobů...34 // 2.5.8 Hniloba a tlení...34 // 2.6 Růst a množení bakterií...34 // 2.6.1. Bakteriální růstový cyklus...35
// 2.6.1.1 Replikace DNA...35 // 2.6.1.2 Úloha cytoplasmatické membrány...35 // 2.6.1.3 Úloha buněčné stěny...35 // 2.6.1.4 Generační doba...36 // 2.6.2 Růstová křivka bakteriální populace...36 // 2.6.3 Růst bakterii v podobč biofilmu...37 // 2j.6j4‘ Faktory ovlivňující množení bakterií...38 // " 2.6.4.1 Voda...38 // 2.6.4.2 Teplota...38 // 2.6.4.3 Hydrostatický tlak...39 // 2.Ó.4.4 Osmotický tlak...39 // 2.6.4.5 Koncentrace vodíkových iontů...39 // 2.6.4.6 Oxidoredukčni potenciál...40 // 2.6.4.7 Záření...40 // 2.7 Pěstování bakterií...40 // > 2.7.1 Historie...40 // 2.7.2 Podmínky pěstováni bakterií in vitro...41 // 2.7.3 Druhy kultivačních půd...41 // 2.7.4 Základní půdy...42 // 2.7.5 Obohacené půdy...42 // 2.7.6 Selektivní půdy...44 // 2.1.1 Diagnostické půdy...44 // 2.7.8 Selektivně diagnostické půdy...46 // 2.7.8.1 Selektivně diagnostické půdy pro gramnegativní mikroby...46 // 2.7.8.2 Selektivně diagnostické půdy pro grampozitivní mikroby...47 // 2.7.9 Půdy к anaerobní kultivaci...47 // 2.7.10 Půdy k antibiotickým zkouškám a ke stanovení účinných látek...47 // 2.7.11 Půdy к uchováváni kultur...47 // 2.7.12 Půdy transportní...48 // 2.8. Bakteriální genetika...48 // 2.8.1. Bakteriální Chromosom...48 // 2.8.2 Exprese genu...49 // 2.8.3 Mutace a oprava DNA...50 // 2.8.4 Plasmidy...50 // 2.8.5 Rekombinace...51 // 2.8.5.1 Heterologní rekombinace...51 // 2.5.5.2 Homologní rekombinace...51
2.8.6 Mezibakteriálni výměna genetické informace...52 // 2.8.6.1 Konjugace...52 // 2.8.6.2 Transformace...52 // 2.8.6.3 Transdukce...53 // 2.8.7 Genetické inženýrství...53 // 3. MIKROBY A MAKROORGANISMUS...55 // 3.1 Infekce a patogenita...57 // 3.2 Kochovy postuláty...58 // 3.3 Rozdíl mezi virulcncí a patogenitou...59 // 3.4 Složky patogenity...61 // 3.5 Průběh, forma a výsledek infekce...62 // 3.5.1 Mikrobiální vlivy...62 // 3.5.2. Vlivy ze strany hostitele...62 // 3.5.3 Vliv prostředí a vstupní brány...63 // 3.5.4 Průběh a formy infekce...63 // 3.5.4.1 Infekce inaparentní a manifestní...63 // 3.5.4.3 Infekce lokální, systémově a generalizované...64 // 3.5.4.4 Infekce akutní, subakutní a chronické...64 // 3.5.4.5 Infekce perzistentní a latentní...64 // 3.5.4.6 Další typy infekcí...65 // 3.5.5 Výsledek infekce...65 // 4. VROZENÁ ODOLNOST PROTI INFEKCI...67 // 4.1 Obrana proti infekci...69 // 4.2 Nástroje nespecifické rezistence...69 // 4.3 Bariéry vůči kolonizaci a penetraci mikrobů...69 // 4.3.1 Kůže...70 // 4.3.2 Sliznice...70 // 4.3.3 Normální mikroflóra...71 // 4.3.4 Funkční překážky...71 // 4.3.5 Specifické způsoby obrany některých sliznic...71 // 4.3.5.1 Respirační trakt...71 // 4.3.5.2 Oční spojivka...72 // 4.3.5.3 Zažívací trakt...72 // 4.3.5.4 Urogcnitální trakt...73 // 4.4 Nástroje nespecifické odolnosti uvnitř organismu...73 // 4.4.1 Rozpoznávací funkce nástrojů vrozené rezistence...73 // 4.4.2
Buněčné bariéry...75 // 4.4.2.1 Fagocyty a fagocytóza...75 // 4.4.2.1.1 Ncutrofily...75 // 4.4.2.1.2 Mnnocyly a makrofágy...76 // 4.4.2.1.3 Vlastní fagocytóza...76 // 4.4.2.2 Dalši buňky uplatňující se v obraně...77 // 4.4.2.2.I NK-bimky...78 // 4.4.2.2.2 Eosinofily...78 // 4.4.2.2.3 Erytrocyty a krevní destičky...78 // 4.4,2.3 Anatomické překážky šíření mikrobů v tčle...78 // 4.4.3 Humorální bariéry...79 // 4.4.3.1 Komplement...79 // 4.4.3.1.1 Komplementový systém a jeho aktivace...79 // 4.4.3.1.2 Alternativní drália...79 // 4.4.3.1.3 Lektinová dráha...81 // 4.3.3.1.4 Klasická dráha...81 // 4.4.3.1.5 Shrnutí významu komplementu v nespecifické rezistenci...82 // 4.4.3.2 Lysozym...82 // 4.4.3.3 Bazické polypeptidy...82 // 4.4.3.4 Inlcrferony...82 // 4.4.4 Ostatní humorální faktory ovlivňující nespecifickou rezistenci...83 // 4.4.4.1 Cytokiny...83 // 4.4.4.2 Proteiny akutní fáze...84 // 4.4.4.5 Horečka...84 // 4.4.4.6 Obranné funkce zánčtu...85 // 5. ZÍSKANÁ ODOLNOST PROTI INFEKCI...87 // 5.1 Základní rysy specifické imunity...89 // 5.2 Primární a sekundární imunitní reakce...90 // 5.3 Mikrobiální antigény...90 // 5.3.1 Bakteriální antigény...91 // 5.3.1.1 Povrchové antigény bakterií...91 // 5.3.1.2 Hlavní extracelulární antigény bakterií...92 // 5.3.2 Virové antigény...93 // 5.3.3 Antigény hub a parazitů...93 // 5.4 Buňky účastníci se specifické imunitní reakce...94 // 5.4.1 Buňky předkládající
antigen...95 // 5.4.2 Buňky В...95 // 5.4.3 Buňky T...96 // 5.4.3.1 Receptor’Г buněk...96 // 5.4.3.2 Thymová výchova...96 // 5.4.3.3 T buněčné subpopuiace...96 // 5.4.3.4 Aktivace buněk T...97 // 5.5 Hlavní hislokompatibilní komplex...98 // 5.6 Solubilní faktory ve specifické imunitní odpovědi...98 // 5.6.1 Inlerleukiny...99 // 5.6.2 Inlcrferony...99 // 5.6.3 Chcmokiny...99 // 5.6.4 Ostatní cytokiny...100 // 5.6.5 Přehled působení cytokinů...100 // 5.7 Protilátky...100 // 5.7.1 Stavba imunoglobulinů...100 // 5.7.2 Vlastnosti jednotlivých tříd imunoglobulinů...101 // 5.7.2.1. Imunoglobulin G...101 // 5.7.2.2 Imunoglobulin M...102 // 5.7.2.3 Imunoglobulin A...102 // 5.7.2.4 Imunoglobulin E...102 // 5.7.2.5 Imunoglobulin D...102 // 5.7.3 Průběh tvorby protilátek...103 // 5.7.4 Reakce protilátek s antigény in vitro...103 // 5.7.4.1 Precipilace...104 // 5.7.4.2 Aglutinace...105 // 5.7.4.3 Aglutinace na nosičích...105 // 5.7.4.4 Komplementfixační reakce...106 // 5.7.4.5 Neutralizace a inhibice biologických vlastností...106 // 5.7.4.6 Reakce se značenými složkami...106 // 5.8 Prolibaktcriální imunita...106 // 5.8.1 Ochranný význam protilátek u bakteriálních nákaz...107 // 5.8.1.1 Podpora fagocytózy...107 // 5.8.1.2 Zábrana adherence...107 // 5.8.1.3 Neutralizace toxinů...107 // 5.8.1.4 Bakteriolýza...107 // 5.8.2 Ochranný význam buněčné imunity...108 // 5.8.3 Faktory ovlivňující protibakteriální odolnost...108 // 5.8.3.1
Genetické a pohlavní faktory v odolnosti...108 // 5.8.3.2 Věkový faktor v odolnosti...109 // 5.9 Poruchy odolnosti...109 // 5.9.1 Stavy snížené odolnosti...109 // 5.9.1.1 Postižení nespecifické rezistence...110 // 5.9.1.2 Postiženi specifické imunity...110 // 5.9.2 Alergické reakce...111 // 5.9.2.1 Přecitlivělost I. typu (anafylaxe a atopie)...111 // 5.9.2.2 Přecitlivělost 11. typu (cytotoxická)...112 // 5.9.2.3 Přecitlivělost 111. typu (Arthusova, z imunokomplexů)...112 // 5.9.2.4 Přecitlivělost IV. typu (pozdní, zprostředkovaná buňkami)...112 // 5.9.3 Autoimunita...113 // 6. FAKTORY PATOGENITY A VIRULENCE...115 // 6.1 Přenosnost (kontagiosita)...117 // 6.2 Invazivita...117 // 6.2.1 Adherence...117 // 6.2.1.1 Pili (fimbrie)...118 // 6.2.1.2 Nefimbriální adhesiny...118 // 6.2.1.3 Adherence u virů, plísni a parazitů...118 // 6.2.2 Průnik do vnitřního prostředí...119 // 6.2.3 Schopnost množit se ve tkáních hostitele...120 // 6.2.4 Schopnost Sířit se organismem...121 // 6.2.5. Schopnost překonávat obranné mechanismy hostitele...122 // 6.2.5.1 Schopnost odolávat nástrojům nespecifické rezistence...122 // 6.2.5.1.1 Schopnost odolávat účinku komplementu...123 // 6.2.5.1.2 Schopnost odolávat fagocytóze...124 // 6.2.5.1.3 Interference s funkcí cylokinit...125 // 6.2.5.2 Schopnost odolávat mechanismům specifické imunity...125 // 6.2.5.2.1 Skrýváni mikroba...126 // 6.2.5.2.2 Antigennímimikry...126 // 6.2.5.2.3 Ukrýváni povrchových
antigenů...126 // 6.2.5.2.4 Navození tolerance...126 // 6.2.5.2.5 Antigenní proměnlivost...127 // 6.2.5.2.6 Potlačeni imunitní reakce...127 // 6.2.5.2.7 Vznik perzistentních a latentních infekcí...128 // 6.3 Toxicita...128 // 6.3.1 Poškozeni vzniklá přímým účinkem infekčního agens...128 // 6.3.1.1 Buněčná smrt...129 // 6.3.1.2 Metabolická postižení...129 // 6.3.1.3 Mechanické příčiny...129 // 6.3.2 Mikrobiální toxiny...129 // 6.3.2.1 Exotoxiny...130 // 6.3.2.1.1 Průnikové faktory...130 // 6.3.2.1.2 Cytolysiny (cytotoxiny, hemolysiny)...130 // 6.3.2.1.3 Toxiny brzdící syntézu bílkovin...130 // 6.3.2.1.4 Farmakologicky účinné toxiny...131 // 6.3.2.1.5 Neurotoxiny...131 // 6.3.2.1.6 Superantigeny...131 // 6.3.2.2 Endotoxiny...131 // 6.3.3 Poškození vzniklá v důsledku obranných reakcí hostitele...132 // 6.3.3.1 Poškození způsobená zánětlivou reakcí...132 // 6.3.3.2 Poškození vzniklá v důsledku specifické imunitní reakce...132 // 7. MIKROBY A PROSTŘEDÍ...135 // 7.1 Úvod...137 // 7.2 Obecné podmínky přežívání a usmrcování mikrobů...137 // 7.2.1 Intenzita, příp. koncentrace antimikrobiálniho agens...137 // 7.2.2 Expoziční doba...137 // 7.2.3 Výchozí počet mikrobů (tzv. úroveň kontaminace)...138 // 7.2.4 Druh a stav mikrobů...’38 // ’ 7.2.5 Ochranný vliv prostředí...138 // 7.2.6 Teplota...>3« // 7.3 Definice běžně užívaných termínů...’38 // 7.4 Vliv teploty na přežívání mikrobů...140
7.4.1 Vliv chladu...’40 // 7.4.2 Vliv zvýšené teploty...,4° // 7.5 Vliv zářeni...141 // 7.6 Voda a její dostupnost...’42 // 7.7 Vliv pH...142 // 7.8 Vliv dalších činitelů zevního prostředí na přežíváni mikrobů...142 // 7.9 Ochrana před mikroby...142 // 8. STERILIZACE A DEZINFEKCE...145 // 8.1 Definice...147 // 8.2 Fyzikální postupy sterilizace a dezinfekce...’47 // 8.2.1 Teplo...147 // 8.2.1.1 Plamen...147 // 8.2.1.2 Horký vzduch...,48 // 8.2.1.3 Pára pod tlakem...148 // 8.2.1.4 Proudící pára...148 // 8.2.1.5 Var...149 // 8.2.1.6 Frakcionovaná sterilizace...*49 // 8.2.1.7 Pasteurizace...149 // 8.2.1.8. Tyndalizace...149 // 8.2.2 Záření a vlnční...149 // 8.2.2.1. Ultrafialové záření...I49 // 8.2.2.2 Infračervené záření...I49 // 8.2.2.3 Ionizační záření...I49 // 5.2.2.4 Ultrazvuk...150 // 8.2.3 Plazma...150 // 8.2.4 Filtrace...150 // 8.2.5 Úklid a mechanická očista...150 // 8.3 Chemické postupy sterilizace a dezinfekce...’ 50 // 8.3.1 Oxidační činidla...153 // 8.3.1.1 Peroxosloučeniny...153 // 8.3.1.2 Ozon...153 // 8.3.1.3 Peroxid vodíku...153 // 8.3.1.4 Manganistan draselný...153 // 8.3.1.5 Další peroxidy a persírany...153 // 8.3.1.6 Superoxidovaná voda...’53 // 8.3.2 Halogeny...154 // 8.3.2.1 Chlor a jeho deriváty...’54 // 8.3.2.2 Jodové preparáty...’54 // 8.3.2.3 Deriváty bromu a fluoru...155 // 8.3.3 Alkylačni činidla...’55 // 8.3.3.1 Ethylenoxid...155 // 8.3.3.2 Formaldehyd...155 // 8.3.3.3 Glularaldchyd...155
a novorozence...227 // 12.2.12 Nosokomiální infekce...227 // 12.3 Nárys laboratorního zpracování nejdůležitějších druhů materiálu...228 // 12.3.1 Zpracování likvoru...228 // 12.3.2. Krev na hemokullivaci...229 // 12.3.3. Sputum, bronchoalveolámí laváž, tracheální aspirát...229 // 12.3.4 Výtěr z krku, nosu, ucha...229 // 12.3.5 Stěr ze spojivky...230 // 12.3.6 Hnis, punktát...230 // 12.3.7 Materiál z kožních lézí...230 // 12.3.8 Vzorky z urethry, cervixu, pochvy...230 // 12.3.9 Moč...230 // 12.3.10. Stolice...231 // Použitá literatura...233 // Seznam tabulek uvedených v knize...245 // Seznam obrázků uvedených v knize...247 // Několik slov závěrem...247