1. Historie mikrobiologie potravin // 1.1. Historie mikroorganismů v potravinách // 2. Mikroorganizmy a potraviny // 2.1. Viry v potravinách // 2.1.1. Bakteriofágy // 2.2. Bakterie v potravinách // 2.2.1. Základní vlastnosti bakterií // 2.2.2. Nejdůležitější rody bakterií vyskytující se v potravinách // 2.3. Mikroskopické houby a potraviny // 2.3.1. Základní vlastnosti plísní // 2.3.2. Přehled hlavních rodů plísní // 2.3.3. Základní vlastnosti kvasinek // 2.3.4. Přehled hlavních rodů kvasinek // 3. Faktory ovlivňující výskyt mikroorganismů v potravinách // 3.1. Vnitřní faktory // 3.1.1 pH // 3.1.2. Vodní aktivita // 3.1.3. Oxidačně-redukční potenciál (Eh) // 3.1.4. Obsah živin // 3.1.5. Antimikrobiální látky // 3.1.6. Biologické struktury // 3.2. Vnější faktory // 3.2.1. Teplota skladování // 3.2.2. Relativní vlhkost prostředí // 3.2.3. Přítomnost a koncentrace plynů // 3.2.4. Přítomnost a aktivita mikroorganismů // 4. Mikrobiologická kontrola potravin // 4.1. Indikátory produkční kvality // 4.2. Indikátory bezpečnosti potravin // 4.2.1. Celkový počet mikroorganismů // 4.2.2. Indikátory fekálního znečištění // 4.2.3. Počet psychrotrofních baktérií // 4.2.4. Počet termorezistentních a termofilních baktérií // 4.2.5. Počet sporulujících bakterií // 4.2.6. Počet proteolytických bakterií // 4.2.7. Počet kvasinek a plísní // 4.3. Metody stanovení mikroorganizmů v potravinách // 4.3.1. Kultivační testy // 4.3.2. Mikroskopie // 4.3.3. Fyzikální, chemické a imunologické testy // 4.3.4. Analýzy nukleových kyselin // 4.3.4.1. Metody založené na amplifikaci nukleových kyselin // 4.3.4.2. Genetický fingerprinting // 5. Mikrobiologie vody // 5.1. Mikrobiologie pitné vody // 5.2. Odpadní vody potravinářského průmyslu //
6. Mikrobiologie mléka a mléčných výrobků // 6.1. Mikrobiologie syrového mléka // 6.2. Mikrobiologie tepelně ošetřeného mléka // 6.2.1. Pasterace // 6.2.2. Ultrapasterace // 6.2.3. UHT ošetření (Ultra-high temperature processing) // 6.3. Kysané tekuté mléčné výrobky // 6.3.1. Jogurty a jogurtová mléka // 6.3.2. Kysané mléko a zakysaná smetana // 6.3.3. Acidofilní mléko // 6.3.4. Kefír // 6.3.5. Vady kysaných tekutých mléčných výrobků // 6.4. Mikrobiologie sýrů // 6.4.1. Sladké sýry // 6.4.2 Kyselé sýry // 6.4.3. Tavené sýry // 6.4.4. Mikrobiologické vady sýrů // 7. Mikrobiologie masa a vajec // 7.1. Mikrobiologie syrového masa // 7.1.1. Zrání masa // 7.1.2. PSE a DFD maso // 7.1.3. Mikrobiální kažení masa // 7.1.4. Mechanizmus kažení masa // 7.2. Fermentované masné výrobky // 7.3. Mikrobiologie vajec // 7.3.1. Mikrobiologie čerstvých vajec // 7.3.2. Mikrobiologie majonéz // 8. Mikrobiologie ostatních potravin // 8.1. Mikrobiologie ovoce a zeleniny // 8.1.1. Plísňové choroby ovoce a zeleniny // 8.1.2. Bakteriální choroby ovoce a zeleniny // 8.1.3. Mražené ovoce a zelenina // 8.1.4. Kysaná zelenina // 8.1.5. Konzervované ovoce a zelenina a rajčatové kečupy // 8.2. Mikrobiologie vína // 8.3. Mikrobiologie piva // 9. Konzervace a sterilace potravin // 9.1. Chemické konzervační látky // 9.2. Biokonzervace // 9.2.1. Etanolové kvašení // 9.2.2. Organické kyseliny // 9.3. Fyzikální metody konzervace // 9.3.1. Ozařování // 9.3.2. Působení nízké teploty // 9.3.3. Působení zvýšené teploty // 9.3.4. Zvýšení obsahu sušiny // 9.3.5. Hydrostatický tlak // 10. Onemocnění z potravin // 10.1. Bakteriální toxiny // 10.2. Stafylokoková gastroenteritida // 10.3. Clostridiumperfringens // 10.4. Botulizmus // 10.7. Escherichia coli //
10.8. Další bakterie způsobující alimentární onemocnění // 10.9. Prionová onemocnění lidí a zvířat // 11. Mykotoxiny v potravinách // 11.1. Aflatoxiny // 11.2. Citrinin // 11.3. Fumonisin // 11.4. Ochratoxiny // 11.5. Trichoteceny // 11.6. Zearalenon // 11.7. Patulin // 11.8. Prevence výskytu mykotoxinů // 12. Mikrobiologické aspekty HACCP systému // 13. Probiotika, prebiotika, synbiotika // 13.1.Probiotika // 13.1.1. Definice probiotik // 13.1.2. Mikroorganizmy používané jako humánní probiotika // 13.1.3. Funkční a technologické vlastnosti probiotických mikroorganizmů // 13.1.4. Přehled zdravotních přínosů probiotik // 13.2. Prebiotika // 13.2.1. Definice prebiotik // 13.2.2. Prebiotika s bifidogenním účinkem // 13.2.3. Požadované vlastnosti prebiotik // 13.2.4. Pozitivní účinky prebiotik // Seznam použité literatury // Příloha 1: Seznam zkratek // Příloha 2: Seznam použitých zkratek rodů mikroorganizmů // Příloha 3: Seznam v ČR povolených chemických konzervačních látek pro potraviny Příloha 4: Nařízení komise Evropských společenství č. 2073/2005 ze dne 15. listopadu 2005 o mikrobiologických kritériích pro potraviny,